Structure de la G6PD humaine

La G6PD humaine est une protéine de 514 acides aminés et a une masse moléculaire de 59 kDa. La forme active résulte d'un équilibre entre dimères et tétramères. La figure montre l'interaction d'un dimère AB avec un dimère CD. Un variant de la G6PD humaine, la G6PD Canton où le résidu d'arginine en 459 est remplacé par une leucine a pu être cristallisée et étudiée par diffraction de rayons X.

Chaque monomère de G6PD a la particularité de contenir une molécule de NADP+ qui fait partie de sa structure propre et se situe à proximité de la zone d'interaction entre les sous-unités du dimère. Ce NADP+ est distinct de celui qui intervient dans la réaction enzymatique. La région N-terminale est stabilisée par un pont disulfure.

En comparant les séquences d'une cinquantaine d'espèces, Notaro, Afolayan et Luzzatto ont identifié 12 régions conservées dans dans la molécule de G6PD qui ont sans doute un rôle dans la fonction et la structure de la molécule.

Les localisations de ces régions et leur fonction probable sont indiquées dans le tableau ci-dessous:








Région I résidus 34-53Exons 2 et 3site de liaison du coenzyme
Région II 137-148Exon 5 core hydrophobe de la protéine
Région III 166-180Exon 6 zone conservée faisant face au centre actif
Région IV 193-218Exon 6site catalytique
Région V 240-274Exon 7-8 zone conservée faisant face au centre actif
Région VI 284-292 Exon 9hélices alpha amphipatiques
Région VII 333-339Exon 9 core hydrophobe de la protéine
Région VIII 347-362Exon 9-10 core hydrophobe de la protéine
Région IX 365-376Exon 10core hydrophobe de la protéine
Région X 388-404Exon10contact entre sous-unités
Région XI 433-443Exon 11core hydrophobe de la protéine
Région XII 451-464Exon 12hélices alpha amphipatiques


Retour